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与新冠新型变异株奥密克戎赛跑,凡知新冠冻 [复制链接]

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12月7日,世卫组织发布新冠肺炎每周流行病学报告。报告指出,已有57个国家和地区出现Omicron(奥密克戎)毒株,大部分病例与旅行相关。

图1:图片来源于网络,若有侵权联系删除

奥密克戎,希腊字母表中的第15个字母。11月26日,它被用来命名首次在南非发现的变异新冠病毒B.1.1.。不少国家和地区因为它收紧了防疫措施,但奥密克戎的传播速度远超人们想象。

一、奥密克戎传播速度有多快?

南非流行病应对与创新中心主任图里奥·德·奥利维拉称,“奥密克戎”似乎传播得非常快,两周时间即成为南非的主要流行毒株,其中疫情最严重的豪登省90%的病例感染均为该毒株。

根据南非国立传染病研究所公布的数据,从11月23日至30日,该国单日新增确诊病例从人迅速上涨到人,增长了4倍。传染病专家威兰德根据现有数据计算称,相比原始新冠毒株,“奥密克戎”的传染性高出5倍,而“德尔塔”仅高出70%。

此外,根据比利时和我国香港地区“奥密克戎”感染病例的PCR检测结果,探测到病毒遗传物质所需的循环数较少,说明患者体内病毒载量很高,传染性较强。

二、奥密克戎传播原因

奥密克戎毒株携带的“大量突变”,是其传染性增强的主要原因。

根据基因测序结果,奥密克戎刺突蛋白有32处突变,德尔塔毒株该区域突变仅有9处。

英国维康桑格研究所新冠病毒基因组学计划负责人杰弗里·巴雷特表示,32个突变中仅有1个可明确为无害突变,有9个曾在“德尔塔”等其他毒株中出现过,是明显的不良突变,可能提高病毒传染性或影响疫苗效果,还有11个新出现的突变,可能具有功能性但作用暂不明确。

美国布鲁姆实验室研究认为,奥密克戎变异株在刺突蛋白“受体结合域”的15处突变中,有多处位于抗体逃逸的“峰值位点”,其中4处严重影响抗体作用,4处中等影响抗体作用。而已经席卷全球的“德尔塔”的“受体结合域”上,一共仅有3处突变。

图2:图片来源于网络,若有侵权联系删除

同时,奥密克戎变异株具有前4个VOC变异株Alpha(阿尔法)、Beta(贝塔)、Gamma(伽玛)和Delta(德尔塔)刺突蛋白的重要氨基酸突变位点,包括细胞受体亲和力、病毒复制能力和免疫逃逸能力增强的位点,这些位点都能增强新变种的传播能力。

1、细胞受体亲和力

刺突蛋白是病毒借以侵入人体细胞大门的“钥匙”,也是大部分疫苗针对的标靶;在受体结合域,即病毒与人体细胞首次接触的部分,发现10个突变。而目前席卷世界的德尔塔变异株在受体结合域只有2个突变。也正是因为奥密克戎变异株的这些变异特点,使它被认为具有更高的传播效率。

2、病毒复制能力

病毒能产生很多突变的条件是,病毒复制的数量要足够多。奥密克戎的变异量为德尔塔4倍,而且首次两种突变同时出现在一种毒株上,使它的病毒复制能力和感染力大大增强。

3、免疫逃逸能力

据路透社报道,南非非洲健康研究所教授AlexSigal当地时间周二(12月7日)在社交平台上公布了第一个奥密克戎血清学数据。这是一项用疫苗接种者血清去做中和奥密克戎病毒的体外中和试验。

数据显示,这些血清对DG(年早期的新冠毒株)的中和活性FRNT50(注:FRNT50几何平均滴度是一项评估中和抗体有效性的指标)是,对奥密克戎突变株则为32,下降41.4倍。因此,对于奥密克戎突变株存在显著免疫逃逸的预测是准确的。

研究表明,新冠病毒S蛋白若出现KN、EA或NY突变,提示免疫逃逸能力增强。而奥密克戎变异株同时存在“KN+EA+NY”三重突变。

图3:图片来源:Pixabay,若有侵权联系删除

但这并不意味着,奥密克戎能够“隔空传播”、“看一眼就能传染”。尽管发生了变异,传播能力增强了,但传播途径仍然是通过呼吸道传染,主要通过飞沫、气溶胶或接触进行传播。

三、凡知冻干核酸检测试剂能否检出奥密克戎变异株?

根据对奥密克戎变异株的基因组分析显示,其突变位点不影响凡知核酸检测试剂的敏感性和特异性。奥密克戎变异株突变的位点主要集中在S蛋白基因的高变异区,而凡知核酸检测试剂检测区域是ORF1ab基因和N基因高度保守区,对检测敏感性和特异性没有影响。

凡知医学对新型冠状病毒变异毒株(包括Omicron、Delta、Alpha等)序列信息进行了检查,发现凡知检测试剂探针不受病毒变异影响,仍然能够有效检测病毒。

四、凡知医学新型冠状病毒相关产品

1、病毒DNA/RNA核酸提取试剂盒(磁珠法)

病毒DNA/RNA提取试剂盒

产品特性:

(1)适用广泛:支持血清、血浆、尿液、CSF、拭子浸泡液、培养液上清等多种样本;

(2)操作便捷:整个操作过程在25分钟之内可获得高质量DNA/RNA;

(3)无污染:能够将污染物与PCR抑制剂彻底去除,保证下游实验;

(4)高灵敏:能够成功提取病毒低拷贝数的核酸;

(5)高效率:手提与高通量自动化提取仪均可适用;

2、一次性使用病毒采样管

免提取一次性病毒采样管2ml

免提取一次性病毒采样管5ml

特点:

(1)无须进行核酸提取,免去提取设备以及提取试剂,极大降低检测成本和检测耗时;

(2)FiregenVMTM为非灭活型鼻/口咽拭子保存液,在4°C至室温区间保持细胞及病毒的完整性;

(3)病毒RNA采集后在保存运输温度范围内不被降解;

(4)采样灭活后的RNA在4°C保存1周稳定,Ct值无变化;

(5)VMTM对RT-PCR无显著抑制作用,对检测反应无不良影响。

采样灭活后的采集管在4℃存放48h、72h后的效果检测:

3、冻干核酸检测试剂

全组份冻干技术,常温运输,无需冷链,比液体试剂更可靠。创新采用单反应微球设计,极大简化操作流程。本试剂盒设有内标,内标为人核糖核酸酶P(RNaseP),采用Cy5荧光素标记,通过内标对待测样本的采集、运输、提取及扩增过程进行监控,避免检测结果的假阴性。

凡知医学冻干核酸检测试剂目前已取得了欧盟CE认证,并进入国家商务部白名单。该产品以冻干状态存在,摆脱冷链保存、运输等条件限制,帮助有关部门将疫情防控迅速延伸至全球的偏远地区和贫困地区,实现了病毒防控“全天候”作战。

冻干核酸检测试剂(西林)

参考资料:

华夏时报

[1]董瑞丰.研判奥密克戎:风险多大?如何防控?[N].新华每日电讯,-12-03().

[2]胡定坤.“奥密克戎”为何让全球“一级戒备”[N].科技日报,-12-02().

[3]陈宁.奥密克戎变异株影响几何[N].浙江日报,-11-30().

关于凡知医学

凡知医学(FireGenBiomedicals)是一家全球化运营的生物医药企业,由拥有世界顶尖药企30年从业资历的海归科学家团队创立,针对重大疾病搭建有先进的新一代核酸快速诊断试剂和仪器研发平台,创新实现了基因测序试剂盒、快速基因检测仪和检测芯片的开发,助推基因快速诊断进入基层医疗体系,致力于打造中国领先的基因快速诊断品牌,提供一体化诊断的仪器、芯片、诊断试剂和部分高端原料。

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